肽的消化吸收是一个杂乱的进程，除受上述消化系统的层层阻止效果外，还受肽自身理化特征以及膳食构成、食量、年纪、代谢类型及其他要素的影响。现在的研讨以为，寡肽比多肽、L型比D型、中性比酸、碱性肽更易吸收。二肽和三肽能完好的吸收，但三肽以上的寡肽是否能完好吸收还存在争议。
一、肽链的性质
现在的研讨以为，肽链中氨基酸残基较少、L型、中性寡肽比氨基酸残基较大多、D型、酸碱性的寡肽更简单吸收。有研讨以为，肠道吸收大于三肽的寡肽的速度要慢于对二肽、三肽的吸收速度。因为三肽以上的寡肽被摄入肠道今后，要在肠道内进一步分解为二肽、三肽今后才干被机体使用，这就降低了这些大于三肽的寡肽的吸收速度。也有研讨者以为大于三肽的寡肽也能够直接被吸收使用，其吸收速度并不差劲于二肽和三肽，但尚没有满足的依据来证实。寡肽的氨基酸构成也能够影响其吸收速度，如，当谷氨酸以谷氨酰胺赖氨酸方式供应时，大鼠小肠对其吸收速度是以谷氨酰胺蛋氨酸方式供应时的二倍。此外，氨基酸残基的构型也能够影响寡肽的吸收。如，当赖氨酸坐落N结尾与组氨酸构成二肽时，被吸收的速度要快于其坐落C结尾时；而当它坐落C结尾与谷氨酸构成二肽时，其吸收速度则更为迅速。
二、机体的营养状况
有研讨报导，长时间对大鼠约束喂饲时，大鼠的肠安排吸收Leu-Met和Leu-Met-Leu-Met的才能较正常时上升。对人体的研讨则发现，约束饮食的时分，小肠内各种肽酶的活性降低，寡肽的释放量降低；而当蛋白质供应足够的时分，肽酶的活性则会添加，从而使寡肽的释放量添加。
三、蛋白质的质量
对动物性、植物性蛋白质进行体外消化试验时发现，在胃蛋白酶和胰蛋白酶的效果下，动物性蛋白质释放出的寡肽和游离氨基酸的份额最高，豆类蛋白次之，而谷物蛋白质的释放量最低。对不一样动植物性蛋白质的胃蛋白酶、胰蛋白酶的水解产品进行反相液相色谱分析也发现，寡肽的释放量由大到小依次为酪蛋白、鱼粉、蚕蛹、豆粕、豆饼、菜籽饼、玉米蛋白粉，蛋白质的寡肽释放量与其所含的有用氨基酸量呈正相关联系。由此能够看出，必需氨基酸含量较高且平衡的优异蛋白在消化进程中对比简单水解生成分子量低且数量很多的寡肽，有利于寡肽的转运吸收；而必需氨基酸缺少且不平衡的蛋白质简单发作很多的游离氨基酸和少数的大分子量的肽片段，不利于寡肽的转运吸收。
四、蛋白质加工、贮存的条件
加工、贮存条件也是影响蛋白质消化进程中寡肽释放量的主要要素之一。体外水解试验中可发现，蒸制加工后的肉品能够释放出的寡肽量较少，而冷冻干燥或新鲜品则能够释放出较多的寡肽。在植物性蛋白中，加热后长时间贮存的豆粕，赖氨酸的释放量仅仅为有用赖氨酸含量高的新鲜豆粕的63%。这可能是因为赖氨酸的侧链-NH2残基简单发作美拉德反响，这是广泛存在于食物、饲料加工中的一种非酶褐变，是氨基化合物和羰基化合物之间发作的非酶反响，也称为羰氨反响。反响经过杂乱的历程，最终生成棕色乃至是黑色的大分子物质黑精或称拟黑素，该反响友法国化学家L.C.Maillard于1912年提出，故称之为Maillard反响，使得赖氨酸残基与其相邻的氨基酸肽键难以开裂，从而影响了蛋白质的消化率。
五、寡肽载体
寡肽载体在寡肽的吸收，转运进程中也表现着主要的效果。它们对底物具有广泛的适应性，能够转运多种化合物，包含寡肽、肽类似物及非肽化合物等。现在现已发现的肽转运载体3、大鼠的肽/组氨酸转运载体1和人的肽/组氨酸转运载体。其间研讨最为广泛的是PepT1和PepT2，二者都是质子依靠的寡肽转运载体家族的成员，PepT1是高容量/低亲和力的载体，PepT2则是低容量/高亲和力的载体。它们都能够转运二肽和三肽，而且以转运膜上的H+梯度为驱动力。人的PepT1现已被成功克隆。其cDNA长度为2.2kb，有一个敞开的阅览框，能够编码有708个氨基酸构成的蛋白质。该蛋白质有12个穿膜区，而且在9区和10区之间有一个对比长的亲水片段。这也是这一组转运蛋白最明显的特征。构造猜测模型标明，亲水环上有多个与N原子相连的糖基化位点和多个依靠蛋白激酶C的磷酸化位点。兔、大鼠、鸡、绵羊的PepT1也都现已相继被成功克隆。它们的cDNA的长度有所不一样，但是它们编码的蛋白质构造上却非常类似：如它们都有12个穿膜区，而且在9区和10区之间有一个对比长的亲水片段。这也是这一组转运蛋白最明显的特征。构造猜测模型标明，亲水环片段坐落细胞膜的外侧，包含有几个与N原子相连的糖基化位点。膜内侧能够包容一切的12个a螺旋，且N结尾和C结尾都坐落细胞质一侧。这些PepT1蛋白具有高度的同源性。大鼠与人的PepT1氨基酸序列有88%的同源性，兔、鸡、绵羊与人的氨基酸序列同源性则分别为81%、62.5%和83%。值得注意的是，一切穿膜区的序列都高度保存，而胞外环上序列保存程度却很低。但这些转运蛋白的氨基酸序列与其他已知的转运蛋白之间却没有较高的同源性。另一种肽转运载体PepT2与PepT1在构造和功能上均有所不一样。人的PepT2cDNA全长为2.7kb，有一个长度为2.2kb的敞开阅览框，能够编码由729个氨基酸构成的蛋白质。PepT1和PepT2的一起特征包含12个穿膜区、一个大的胞外环和几个依靠于磷酸化的蛋白激酶联系位点。PepT1和PepT2归于两个不一样的转运系统，同种动物的PepT1和PepT2比较，其同源性低于不一样动物相同转运系统之间的同源性。它们的安排分部也有所不一样。经过对编码蛋白的mRNA的研讨标明，PepT1主要在消化道中表达，在肾脏中也有弱小的表达，而PepT2主要是肾脏肽转运载体。