长期以来，由于人们对食品添加剂缺乏科学的认识以及宣传的误导，导致食品添加剂行业的生存和发展环境越来越差，食品添加剂经常被误解成食品安全事故的罪魁祸首。面对我国食品添加剂和配料行业发展过程中存在的问题，专家称，走新型工业化道路和创新型产业化道路，是我国食品添加剂与配料产业转型升级的主要途径。
功能创新
功能性食品添加剂和食品配料能够为具有营养功能、感觉功能和调节生理活动的食品提供主要的功能成分。而能够增强体质、预防疾病、帮助恢复健康、调节身体节律和延缓哀老的食品配料则属于功能性食品配料。
功能性食品添加剂与配料为食品工业开创了新的前景，在未来几年中，与健康相关的产业就将为美国经济带来每年10000亿美元的收益，这些收益来自为消费者提供健康保健、延缓衰老、预防疾病的产品和服务等。
食品添加剂如茶多酚、甘草抗氧剂、红曲米、葡萄皮红、紫草红、甘草甜、胡萝巴胶、海藻酸钾等，它们大多具有抗氧化、抗癌、抗病毒、抗菌、抗辐射、降脂、降压、防龋齿、消臭、护肝、预防冠心病和动脉硬化等功效。
世界各国的有机食品、绿色食品、功能食品、健康食品等，成为了食品工业新的增长点，食品营养化、功能化是我国食品工业发展的主要趋势，由此看来，食品添加剂和配料的功能化是我国乃至国际食品工业的发展趋势。
据专家预测，在土地革命、工业革命、商业革命、电脑信息网络革命之后，即将到来的将会是营养保健食品的革命。营养保健食品成为保健产业的核心部分，而保健革命被誉为21世纪的财富第五波。
资源创新
据权威资料显示，就全球植物资源丰富度而言，马来西亚排名第一、巴西第二、中国第三。中国的农作物中，淀粉糖类植物有300多种，油脂植物有600多种。其中，蔬菜植物90多种、药用植物4000多种、果品植物300多种、纤维植物500多种，中国食用菌资源占世界的70%。我国天然资源较丰富，经过中国卫生部批准的食药两用的植物种类众多，这些植物均有着独特的性能和功效。
天然色素主要从植物中提取，很多都具有生理活性。近十多年来，经国家批准使用的天然着色剂品种，已从20多种增加到40多种，我国是目前世界上批准天然着色剂最多的国家。很多天然着色剂都具有防病抗病功能，例如，姜黄具有抗癌作用，红花黄有降压作用，辣椒红有抗氧化作用，玉米黄有抗癌、抗氧化作用，红曲米有降血脂作用，桑葚红有降血脂作用，花生衣红有凝血作用，葡萄皮红有调脂作用，紫草红有抗炎症作用，茶绿素有调血脂作用等，而从万寿菊中提取的叶黄素能有效减少老年性视网膜黄斑变性和白内障等疾病的发生。
技术创新
食品添加剂与配料产业的技术创新应围绕原料、工艺、工程、产品、副产、排放及产业链等7个环节进行开展。
食品添加剂和配料产业的发展需要采取微波真空冷冻干燥、微波干燥等干燥技术，超临界萃取，微波、超声波等萃取技术，超重力场分离、层析分离、模拟移动床分离
、分子蒸馏、膜蒸馏等分离和纯化技术，以及微胶囊技术、沸腾造粒、超微化等制剂和形态加工技术等先进技术对其进行技术创新。
工艺创新
食品添加剂与配料产业发展需要对发酵工艺、酶解工艺等生物转化工艺，提取、分离、纯化等物理加工工艺，催化氢化、分子修饰、高压氢解等化学转化工艺，微反应工艺、无废加工工艺等绿色工艺，进行全方位的工艺创新。
在发酵工艺、酶解工艺方面，酶工程已经在开发生物活性肽、功能性低聚糖、氨基酸等功能性食品配料中得到应用，其中功能低聚糖应用最多，大部分低聚糖的生产需要采用酶制剂来进行，以淀粉为原料酶法制取低聚糖，主要有低聚麦芽糖、低聚异麦芽糖、低聚果糖等。迄今从生物界已经发现了上千种酶，用于工业生产的有百余种，但在农产品加工中应用的酶仅有几十种，因此，利用酶工程技术对原材料加工、开发功能性配料新产品、探索新工艺都具有重要作用。
产品创新
资源创新。目前，国家已经批准人参（人工种植）雨生红球藻、表没食子儿茶素没食子酸酯、金花茶、显脉旋覆花小黑药、诺丽果浆、酵母β-葡聚糖、雪莲培养物、茶叶籽油、盐藻及提取物、鱼油及提取物、甘油二酯油、地龙蛋白、乳矿物盐、牛奶碱性蛋白、海藻糖、异麦芽、低聚木糖、蛹虫草子实体、精制首乌粉、精制松花粉、植物甾烷醇酯等一大批的新资源食品。
功能性配料产品及复配产品创新。相同功能的食品添加剂复合在一起，复合组分中的各材料可以起到协同增效的作用。不同功能的食品添加剂复合在一起，复合组分中各种材料可以发挥各种功能的作用，起到多用途的功能，甚至发生新效作用。此外，新型乳化剂月桂酰乳酸钠与其他乳化剂进行复配，能有效提高其亲水性，使其乳化性能更好。
制剂和产品形态创新。采用微胶囊或纳米技术对产品形态进行创新。纳米技术在功能性食品方面的应用主要集中在营养元素及功能物质纳米化、具有包裹能力纳米级胶囊等作为功能性食品成分载体及纳米乳化液的应用。
文化创新
食品添加剂与配料的行业文化创新可有效促进整个食品添加剂和配料行业的发展。
产品文化创新。注重产品文化价值的宣传，产品经营转向营销经营、品牌经营，乃至文化经营。
企业文化创新。企业文化是企业的灵魂，是推动企业发展的不竭动力，其核心是企业的精神和价值观。
行业文化创新。行业文化是一个行业在长期运行过程中经过提炼而形成的价值观念、行为方式和行为规范。
浙江科技学院生物与化学工程学院龚金炎博士认为，生产力是推动社会发展的根本力量，是社会发展过程中最活跃的生产要素。行业是生产力的直接组织者和参与者，在生产经营活动中产生的行业文化，往往最先反映时代的新观念、新思想。在我国，企业文化得到重视，但行业文化还没得到应有的培育和规范。具有凝聚力的行业文化，不仅是行业可持续发展的驱动力，也是行业管理的核心和灵魂。行业文化与企业文化相比，具有更大的覆盖面，更强的历史传承性和社会效应。一个行业的文化发达程度，也深刻影响着行业的发展模式、制度选择、政策取向以及各种资源开发和生产要素组合的水平，从而也影响着行业的发展速度和发展水平。
当前背景下，培育食品添加剂与配料行业的价值观文化显得至关重要。要培育食品添加剂与配料的行业文化，以文化创新成为推动整个产业发展的一个创新要素，以食品添加剂与配料行业的价值观文化来展现食品添加剂和配料行业存在的价值。
目前，发达国家在世界范围内将技术领先优势迅速转化为市场垄断优势，以专利为先导、以知识产权保护为手段，不断提高技术门槛，扩大竞争优势，占领全球市场，跨国公司通过资本整合，专利、技术、材料和装备的垄断以及人才的争夺，使我国食品加工产业和食品添加剂产业不得不全面参与国际竞争，这对我国食品加工产业和食品添加剂产业和产业整体技术发展来说，都是十分严峻的挑战。
食品添加剂与配料产业在我国经过二十多年的发展，已初步发展成规模化、集约化经营的现代化食品添加剂与配料工业，食品添加剂与配料工业既是一个新兴产业，更是一个战略性新兴产业，只有从功能、资源、技术、工艺、产品、文化等六方面进行全面创新，才能有效推进整个食品添加剂和配料行业的转型升级，从而推进我国食品工业的发展。